พิพิธภัณฑ์สภากาชาดไทย จัดตั้งขึ้นตามพระราชดำริของสมเด็จพระเทพรัตนราชสุดาฯ สยามบรมราชกุมารี ในปี พ.ศ.2546 เพื่อเฉลิมพระเกียรติ 72 พรรษา สมเด็จพระนางเจ้าสิริกิติ์พระบรมราชินีนาถ สภานายิกาสภากาชาดไทย โดยมีพระราชประสงค์ ให้นำเสนอในรูปแบบพิพิธภัณฑ์ที่มีชีวิต (Living Museum) เช่นเดียวกับพิพิธภัณฑ์สภากาชาดสากล ณ นครเจนีวา ประเทศสวิตเซอร์แลนด์ และได้เปิดให้บริการแก่ประชาชน ตั้งแต่วันที่ 3 มกราคม พ.ศ.2550 เป็นต้นมา
ตึกกาชาด & ตึกมหิดลวงศานุสรณ์
ปี พ.ศ. 2496
กรรมการอำนวยการงานฉลองรัฐธรรมนูญประจำปี พ.ศ. 2483 ได้มอบเงินจำนวน 20,000 บาท เพื่อให้ดำเนินการสร้าง “ตึกกาชาด” บริเวณกองวิทยาศาสตร์ สถานเสาวภาเพื่อใช้เป็นห้องเรียนของสภากาชาดและใช้เป็นสถานที่ดูการแสดงในสนามเวลาที่มีงานกาชาดประจำปี
ปี พ.ศ. 2496
พระบาทสมเด็จพระบรมชนกาธิเบศรมหาภูมิพลอดุลยเดชมหาราชบรมนาถบพิตร พระราชทานพระราชทรัพย์ จำนวน 500,000 บาท สำหรับก่อสร้าง “ตึกมหิดลวงศานุสรณ์” และจัดซื้ออุปกรณ์ต่าง ๆ ในกิจการของกองวิทยาศาสตร์ สถานเสาวภา เพื่อเป็นสถานที่ ค้นคว้าและทดลองผลิตวัคซีนบีซีจีขึ้นใช้เองภายในประเทศ
ปี พ.ศ. 2496
ศูนย์วิจัยโรคเอดส์ สภากาชาดไทย จัดตั้ง “คลีนิคนิรนาม” เพื่อให้บริการตรวจเลือดโดยไม่ต้องบอกชื่อและที่อยู่ ณ ตึกกาชาด เปิดบริการเมื่อวันที่ 4 กรกฏาคม พ.ศ. 2534 โดยดำเนินการจนถึงเดือนมิถุนายน พ.ศ. 2546
ปี พ.ศ. 2549
ได้มีการบูรณะปรับปรุงตึกกาชาดเพื่อจัดทำเป็น “พิพิธภัณฑ์สภากาชาดไทย” เปิดให้เข้าชมครั้งแรกเมื่อวันศุกร์ที่ 29 ธันวาคม พ.ศ. 2549
ปี พ.ศ. 2559
“อาคารมหิดลวงศานุสรณ์” ได้ปรับเปลี่ยนพื้นที่จากอาคารปฏิบัติการและผลิตวัคซีนป้องกันวัณโรค เป็นอาคารหอจดหมายเหตุมหิดลวงศานุสรณ์สภากาชาดไทย เปิดทำการเมื่อวันที่ 27 เมษายน พ.ศ.2559
